Protein–RNA interactions for Protein: E9PQ18

Putative short transient receptor potential channel 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PQ18 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
E9PQ18 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
E9PQ18 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
E9PQ18 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
E9PQ18 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
E9PQ18 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
E9PQ18 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
E9PQ18 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
E9PQ18 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
E9PQ18 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
E9PQ18 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
E9PQ18 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
E9PQ18 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
E9PQ18 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
E9PQ18 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
E9PQ18 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
E9PQ18 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
E9PQ18 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
E9PQ18 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
E9PQ18 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
E9PQ18 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
E9PQ18 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
E9PQ18 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
E9PQ18 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
E9PQ18 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
E9PQ18 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
E9PQ18 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
E9PQ18 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
E9PQ18 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
E9PQ18 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
E9PQ18 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
E9PQ18 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
E9PQ18 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
E9PQ18 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
E9PQ18 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
E9PQ18 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
E9PQ18 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
E9PQ18 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
E9PQ18 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
E9PQ18 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
E9PQ18 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
E9PQ18 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
E9PQ18 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
E9PQ18 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
E9PQ18 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
E9PQ18 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
E9PQ18 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
E9PQ18 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
E9PQ18 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
E9PQ18 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
E9PQ18 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
E9PQ18 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
E9PQ18 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
E9PQ18 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
E9PQ18 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
E9PQ18 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
E9PQ18 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
E9PQ18 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
E9PQ18 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
E9PQ18 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
E9PQ18 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
E9PQ18 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
E9PQ18 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
E9PQ18 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
E9PQ18 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
E9PQ18 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
E9PQ18 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
E9PQ18 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
E9PQ18 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
E9PQ18 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
E9PQ18 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
E9PQ18 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
E9PQ18 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
E9PQ18 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
E9PQ18 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
E9PQ18 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
E9PQ18 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
E9PQ18 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
E9PQ18 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
E9PQ18 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
E9PQ18 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
E9PQ18 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
E9PQ18 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
E9PQ18 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
E9PQ18 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
E9PQ18 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
E9PQ18 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
E9PQ18 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
E9PQ18 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
E9PQ18 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
E9PQ18 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
E9PQ18 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
E9PQ18 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
E9PQ18 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
E9PQ18 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
E9PQ18 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
E9PQ18 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
E9PQ18 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
E9PQ18 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
E9PQ18 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms