Protein–RNA interactions for Protein: C9J4A7

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9J4A7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C9J4A7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C9J4A7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C9J4A7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C9J4A7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C9J4A7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C9J4A7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C9J4A7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C9J4A7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
C9J4A7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
C9J4A7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
C9J4A7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
C9J4A7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
C9J4A7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C9J4A7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C9J4A7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
C9J4A7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C9J4A7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C9J4A7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C9J4A7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C9J4A7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C9J4A7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C9J4A7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C9J4A7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C9J4A7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C9J4A7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C9J4A7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C9J4A7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C9J4A7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C9J4A7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C9J4A7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C9J4A7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C9J4A7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C9J4A7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C9J4A7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C9J4A7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C9J4A7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C9J4A7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C9J4A7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C9J4A7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C9J4A7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C9J4A7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C9J4A7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C9J4A7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C9J4A7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C9J4A7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C9J4A7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C9J4A7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C9J4A7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C9J4A7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C9J4A7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C9J4A7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
C9J4A7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C9J4A7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C9J4A7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C9J4A7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C9J4A7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C9J4A7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C9J4A7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C9J4A7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C9J4A7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C9J4A7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C9J4A7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C9J4A7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C9J4A7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C9J4A7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C9J4A7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C9J4A7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C9J4A7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C9J4A7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C9J4A7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C9J4A7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C9J4A7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
C9J4A7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
C9J4A7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C9J4A7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C9J4A7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C9J4A7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C9J4A7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9J4A7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
C9J4A7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9J4A7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9J4A7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9J4A7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9J4A7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9J4A7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9J4A7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9J4A7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
C9J4A7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9J4A7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9J4A7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9J4A7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9J4A7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9J4A7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9J4A7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9J4A7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9J4A7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
C9J4A7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9J4A7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9J4A7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174.9 ms