Protein–RNA interactions for Protein: A8K0S8

MEIS3P2, Putative homeobox protein Meis3-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3P2A8K0S8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MEIS3P2A8K0S8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MEIS3P2A8K0S8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MEIS3P2A8K0S8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MEIS3P2A8K0S8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MEIS3P2A8K0S8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MEIS3P2A8K0S8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MEIS3P2A8K0S8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MEIS3P2A8K0S8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MEIS3P2A8K0S8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MEIS3P2A8K0S8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
MEIS3P2A8K0S8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
MEIS3P2A8K0S8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MEIS3P2A8K0S8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MEIS3P2A8K0S8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MEIS3P2A8K0S8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MEIS3P2A8K0S8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MEIS3P2A8K0S8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MEIS3P2A8K0S8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MEIS3P2A8K0S8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MEIS3P2A8K0S8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
MEIS3P2A8K0S8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MEIS3P2A8K0S8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MEIS3P2A8K0S8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MEIS3P2A8K0S8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
MEIS3P2A8K0S8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MEIS3P2A8K0S8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MEIS3P2A8K0S8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MEIS3P2A8K0S8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
MEIS3P2A8K0S8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MEIS3P2A8K0S8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MEIS3P2A8K0S8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MEIS3P2A8K0S8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MEIS3P2A8K0S8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MEIS3P2A8K0S8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MEIS3P2A8K0S8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MEIS3P2A8K0S8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MEIS3P2A8K0S8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MEIS3P2A8K0S8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MEIS3P2A8K0S8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MEIS3P2A8K0S8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MEIS3P2A8K0S8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MEIS3P2A8K0S8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MEIS3P2A8K0S8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MEIS3P2A8K0S8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MEIS3P2A8K0S8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
MEIS3P2A8K0S8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MEIS3P2A8K0S8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MEIS3P2A8K0S8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MEIS3P2A8K0S8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MEIS3P2A8K0S8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MEIS3P2A8K0S8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MEIS3P2A8K0S8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MEIS3P2A8K0S8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MEIS3P2A8K0S8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MEIS3P2A8K0S8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MEIS3P2A8K0S8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MEIS3P2A8K0S8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MEIS3P2A8K0S8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MEIS3P2A8K0S8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
MEIS3P2A8K0S8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MEIS3P2A8K0S8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MEIS3P2A8K0S8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MEIS3P2A8K0S8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
MEIS3P2A8K0S8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
MEIS3P2A8K0S8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MEIS3P2A8K0S8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MEIS3P2A8K0S8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MEIS3P2A8K0S8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MEIS3P2A8K0S8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MEIS3P2A8K0S8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MEIS3P2A8K0S8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MEIS3P2A8K0S8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MEIS3P2A8K0S8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MEIS3P2A8K0S8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MEIS3P2A8K0S8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MEIS3P2A8K0S8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MEIS3P2A8K0S8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MEIS3P2A8K0S8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
MEIS3P2A8K0S8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MEIS3P2A8K0S8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MEIS3P2A8K0S8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MEIS3P2A8K0S8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MEIS3P2A8K0S8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MEIS3P2A8K0S8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MEIS3P2A8K0S8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MEIS3P2A8K0S8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MEIS3P2A8K0S8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MEIS3P2A8K0S8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MEIS3P2A8K0S8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MEIS3P2A8K0S8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MEIS3P2A8K0S8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MEIS3P2A8K0S8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MEIS3P2A8K0S8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MEIS3P2A8K0S8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MEIS3P2A8K0S8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MEIS3P2A8K0S8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MEIS3P2A8K0S8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MEIS3P2A8K0S8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MEIS3P2A8K0S8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms