Protein–RNA interactions for Protein: A6NNA2

SRRM3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM3A6NNA2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRRM3A6NNA2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRRM3A6NNA2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRRM3A6NNA2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRRM3A6NNA2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SRRM3A6NNA2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRRM3A6NNA2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SRRM3A6NNA2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRRM3A6NNA2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRRM3A6NNA2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRRM3A6NNA2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRRM3A6NNA2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRRM3A6NNA2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRRM3A6NNA2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRRM3A6NNA2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRRM3A6NNA2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRRM3A6NNA2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRRM3A6NNA2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRRM3A6NNA2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRRM3A6NNA2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRRM3A6NNA2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRRM3A6NNA2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SRRM3A6NNA2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SRRM3A6NNA2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SRRM3A6NNA2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SRRM3A6NNA2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRRM3A6NNA2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRRM3A6NNA2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRRM3A6NNA2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRRM3A6NNA2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRRM3A6NNA2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRRM3A6NNA2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRRM3A6NNA2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRRM3A6NNA2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRRM3A6NNA2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRRM3A6NNA2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRRM3A6NNA2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRRM3A6NNA2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRRM3A6NNA2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SRRM3A6NNA2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRRM3A6NNA2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRRM3A6NNA2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRRM3A6NNA2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SRRM3A6NNA2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRRM3A6NNA2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRRM3A6NNA2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRRM3A6NNA2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRRM3A6NNA2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRRM3A6NNA2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRRM3A6NNA2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRRM3A6NNA2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRRM3A6NNA2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRRM3A6NNA2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRRM3A6NNA2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRRM3A6NNA2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRRM3A6NNA2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SRRM3A6NNA2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRRM3A6NNA2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRRM3A6NNA2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRRM3A6NNA2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRRM3A6NNA2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRRM3A6NNA2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRRM3A6NNA2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRRM3A6NNA2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRRM3A6NNA2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRRM3A6NNA2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRRM3A6NNA2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRRM3A6NNA2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRRM3A6NNA2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRRM3A6NNA2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRRM3A6NNA2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRRM3A6NNA2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRRM3A6NNA2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRRM3A6NNA2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRRM3A6NNA2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRRM3A6NNA2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRRM3A6NNA2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRRM3A6NNA2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRRM3A6NNA2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRRM3A6NNA2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRRM3A6NNA2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRRM3A6NNA2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRRM3A6NNA2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRRM3A6NNA2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRRM3A6NNA2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRRM3A6NNA2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRRM3A6NNA2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SRRM3A6NNA2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SRRM3A6NNA2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SRRM3A6NNA2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SRRM3A6NNA2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SRRM3A6NNA2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SRRM3A6NNA2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SRRM3A6NNA2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SRRM3A6NNA2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SRRM3A6NNA2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRRM3A6NNA2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRRM3A6NNA2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRRM3A6NNA2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRRM3A6NNA2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms