Protein–RNA interactions for Protein: A6NGC4

TLCD2, TLC domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLCD2A6NGC4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TLCD2A6NGC4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TLCD2A6NGC4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TLCD2A6NGC4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TLCD2A6NGC4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TLCD2A6NGC4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TLCD2A6NGC4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TLCD2A6NGC4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TLCD2A6NGC4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TLCD2A6NGC4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TLCD2A6NGC4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TLCD2A6NGC4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TLCD2A6NGC4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TLCD2A6NGC4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TLCD2A6NGC4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TLCD2A6NGC4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TLCD2A6NGC4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TLCD2A6NGC4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TLCD2A6NGC4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TLCD2A6NGC4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TLCD2A6NGC4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TLCD2A6NGC4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TLCD2A6NGC4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TLCD2A6NGC4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TLCD2A6NGC4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TLCD2A6NGC4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TLCD2A6NGC4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TLCD2A6NGC4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TLCD2A6NGC4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TLCD2A6NGC4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TLCD2A6NGC4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TLCD2A6NGC4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TLCD2A6NGC4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TLCD2A6NGC4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TLCD2A6NGC4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TLCD2A6NGC4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TLCD2A6NGC4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TLCD2A6NGC4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TLCD2A6NGC4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TLCD2A6NGC4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TLCD2A6NGC4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TLCD2A6NGC4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TLCD2A6NGC4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TLCD2A6NGC4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TLCD2A6NGC4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TLCD2A6NGC4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TLCD2A6NGC4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TLCD2A6NGC4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TLCD2A6NGC4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TLCD2A6NGC4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TLCD2A6NGC4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TLCD2A6NGC4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TLCD2A6NGC4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TLCD2A6NGC4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TLCD2A6NGC4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TLCD2A6NGC4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TLCD2A6NGC4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TLCD2A6NGC4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TLCD2A6NGC4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TLCD2A6NGC4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TLCD2A6NGC4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TLCD2A6NGC4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TLCD2A6NGC4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TLCD2A6NGC4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TLCD2A6NGC4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TLCD2A6NGC4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TLCD2A6NGC4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TLCD2A6NGC4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TLCD2A6NGC4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TLCD2A6NGC4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TLCD2A6NGC4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TLCD2A6NGC4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TLCD2A6NGC4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TLCD2A6NGC4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TLCD2A6NGC4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TLCD2A6NGC4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TLCD2A6NGC4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TLCD2A6NGC4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TLCD2A6NGC4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TLCD2A6NGC4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TLCD2A6NGC4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TLCD2A6NGC4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TLCD2A6NGC4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TLCD2A6NGC4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TLCD2A6NGC4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TLCD2A6NGC4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TLCD2A6NGC4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TLCD2A6NGC4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TLCD2A6NGC4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TLCD2A6NGC4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TLCD2A6NGC4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TLCD2A6NGC4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TLCD2A6NGC4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TLCD2A6NGC4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TLCD2A6NGC4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TLCD2A6NGC4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TLCD2A6NGC4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TLCD2A6NGC4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TLCD2A6NGC4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TLCD2A6NGC4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms