Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
VPS37CA5D8V6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
VPS37CA5D8V6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
VPS37CA5D8V6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VPS37CA5D8V6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
VPS37CA5D8V6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
VPS37CA5D8V6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
VPS37CA5D8V6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VPS37CA5D8V6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VPS37CA5D8V6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
VPS37CA5D8V6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
VPS37CA5D8V6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VPS37CA5D8V6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VPS37CA5D8V6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VPS37CA5D8V6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VPS37CA5D8V6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VPS37CA5D8V6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VPS37CA5D8V6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VPS37CA5D8V6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VPS37CA5D8V6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VPS37CA5D8V6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VPS37CA5D8V6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VPS37CA5D8V6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VPS37CA5D8V6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VPS37CA5D8V6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VPS37CA5D8V6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VPS37CA5D8V6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
VPS37CA5D8V6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VPS37CA5D8V6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VPS37CA5D8V6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VPS37CA5D8V6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VPS37CA5D8V6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VPS37CA5D8V6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VPS37CA5D8V6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VPS37CA5D8V6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VPS37CA5D8V6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VPS37CA5D8V6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
VPS37CA5D8V6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VPS37CA5D8V6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VPS37CA5D8V6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VPS37CA5D8V6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VPS37CA5D8V6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
VPS37CA5D8V6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VPS37CA5D8V6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VPS37CA5D8V6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VPS37CA5D8V6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VPS37CA5D8V6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VPS37CA5D8V6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VPS37CA5D8V6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VPS37CA5D8V6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
VPS37CA5D8V6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
VPS37CA5D8V6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
VPS37CA5D8V6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
VPS37CA5D8V6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VPS37CA5D8V6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
VPS37CA5D8V6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VPS37CA5D8V6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
VPS37CA5D8V6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
VPS37CA5D8V6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VPS37CA5D8V6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VPS37CA5D8V6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VPS37CA5D8V6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VPS37CA5D8V6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VPS37CA5D8V6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VPS37CA5D8V6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VPS37CA5D8V6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VPS37CA5D8V6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VPS37CA5D8V6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
VPS37CA5D8V6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VPS37CA5D8V6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VPS37CA5D8V6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VPS37CA5D8V6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VPS37CA5D8V6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
VPS37CA5D8V6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VPS37CA5D8V6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VPS37CA5D8V6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VPS37CA5D8V6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
VPS37CA5D8V6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
VPS37CA5D8V6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VPS37CA5D8V6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
VPS37CA5D8V6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VPS37CA5D8V6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VPS37CA5D8V6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VPS37CA5D8V6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VPS37CA5D8V6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VPS37CA5D8V6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
VPS37CA5D8V6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
VPS37CA5D8V6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
VPS37CA5D8V6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VPS37CA5D8V6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VPS37CA5D8V6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VPS37CA5D8V6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VPS37CA5D8V6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
VPS37CA5D8V6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
VPS37CA5D8V6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VPS37CA5D8V6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VPS37CA5D8V6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
VPS37CA5D8V6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VPS37CA5D8V6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VPS37CA5D8V6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms