Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GVQ3

LINC00854, Long intergenic non-protein coding RNA 854, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00854A0A1B0GVQ3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00854A0A1B0GVQ3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00854A0A1B0GVQ3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00854A0A1B0GVQ3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00854A0A1B0GVQ3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00854A0A1B0GVQ3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00854A0A1B0GVQ3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00854A0A1B0GVQ3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00854A0A1B0GVQ3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00854A0A1B0GVQ3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00854A0A1B0GVQ3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00854A0A1B0GVQ3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00854A0A1B0GVQ3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00854A0A1B0GVQ3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00854A0A1B0GVQ3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00854A0A1B0GVQ3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00854A0A1B0GVQ3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00854A0A1B0GVQ3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00854A0A1B0GVQ3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00854A0A1B0GVQ3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00854A0A1B0GVQ3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00854A0A1B0GVQ3 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00854A0A1B0GVQ3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LINC00854A0A1B0GVQ3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LINC00854A0A1B0GVQ3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00854A0A1B0GVQ3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00854A0A1B0GVQ3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00854A0A1B0GVQ3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00854A0A1B0GVQ3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00854A0A1B0GVQ3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00854A0A1B0GVQ3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00854A0A1B0GVQ3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00854A0A1B0GVQ3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00854A0A1B0GVQ3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00854A0A1B0GVQ3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00854A0A1B0GVQ3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00854A0A1B0GVQ3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00854A0A1B0GVQ3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00854A0A1B0GVQ3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00854A0A1B0GVQ3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00854A0A1B0GVQ3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00854A0A1B0GVQ3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00854A0A1B0GVQ3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00854A0A1B0GVQ3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00854A0A1B0GVQ3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00854A0A1B0GVQ3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00854A0A1B0GVQ3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00854A0A1B0GVQ3 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00854A0A1B0GVQ3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00854A0A1B0GVQ3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00854A0A1B0GVQ3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00854A0A1B0GVQ3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00854A0A1B0GVQ3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00854A0A1B0GVQ3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00854A0A1B0GVQ3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00854A0A1B0GVQ3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00854A0A1B0GVQ3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00854A0A1B0GVQ3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00854A0A1B0GVQ3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00854A0A1B0GVQ3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00854A0A1B0GVQ3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00854A0A1B0GVQ3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00854A0A1B0GVQ3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00854A0A1B0GVQ3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00854A0A1B0GVQ3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00854A0A1B0GVQ3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00854A0A1B0GVQ3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00854A0A1B0GVQ3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00854A0A1B0GVQ3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00854A0A1B0GVQ3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00854A0A1B0GVQ3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00854A0A1B0GVQ3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00854A0A1B0GVQ3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00854A0A1B0GVQ3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00854A0A1B0GVQ3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00854A0A1B0GVQ3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00854A0A1B0GVQ3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00854A0A1B0GVQ3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00854A0A1B0GVQ3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00854A0A1B0GVQ3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00854A0A1B0GVQ3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00854A0A1B0GVQ3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00854A0A1B0GVQ3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00854A0A1B0GVQ3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00854A0A1B0GVQ3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00854A0A1B0GVQ3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00854A0A1B0GVQ3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00854A0A1B0GVQ3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00854A0A1B0GVQ3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LINC00854A0A1B0GVQ3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LINC00854A0A1B0GVQ3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LINC00854A0A1B0GVQ3 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LINC00854A0A1B0GVQ3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LINC00854A0A1B0GVQ3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LINC00854A0A1B0GVQ3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LINC00854A0A1B0GVQ3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LINC00854A0A1B0GVQ3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LINC00854A0A1B0GVQ3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LINC00854A0A1B0GVQ3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00854A0A1B0GVQ3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms