Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
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