Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PAXBP1Q9Y5B6 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PAXBP1Q9Y5B6 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PAXBP1Q9Y5B6 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PAXBP1Q9Y5B6 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PAXBP1Q9Y5B6 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PAXBP1Q9Y5B6 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PAXBP1Q9Y5B6 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PAXBP1Q9Y5B6 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PAXBP1Q9Y5B6 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PAXBP1Q9Y5B6 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PAXBP1Q9Y5B6 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PAXBP1Q9Y5B6 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PAXBP1Q9Y5B6 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PAXBP1Q9Y5B6 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PAXBP1Q9Y5B6 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PAXBP1Q9Y5B6 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PAXBP1Q9Y5B6 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PAXBP1Q9Y5B6 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PAXBP1Q9Y5B6 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PAXBP1Q9Y5B6 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PAXBP1Q9Y5B6 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PAXBP1Q9Y5B6 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PAXBP1Q9Y5B6 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PAXBP1Q9Y5B6 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PAXBP1Q9Y5B6 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PAXBP1Q9Y5B6 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PAXBP1Q9Y5B6 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PAXBP1Q9Y5B6 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PAXBP1Q9Y5B6 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PAXBP1Q9Y5B6 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PAXBP1Q9Y5B6 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PAXBP1Q9Y5B6 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PAXBP1Q9Y5B6 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PAXBP1Q9Y5B6 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PAXBP1Q9Y5B6 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PAXBP1Q9Y5B6 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PAXBP1Q9Y5B6 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PAXBP1Q9Y5B6 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PAXBP1Q9Y5B6 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PAXBP1Q9Y5B6 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PAXBP1Q9Y5B6 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PAXBP1Q9Y5B6 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PAXBP1Q9Y5B6 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PAXBP1Q9Y5B6 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PAXBP1Q9Y5B6 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PAXBP1Q9Y5B6 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PAXBP1Q9Y5B6 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PAXBP1Q9Y5B6 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PAXBP1Q9Y5B6 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PAXBP1Q9Y5B6 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PAXBP1Q9Y5B6 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PAXBP1Q9Y5B6 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PAXBP1Q9Y5B6 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PAXBP1Q9Y5B6 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PAXBP1Q9Y5B6 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PAXBP1Q9Y5B6 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PAXBP1Q9Y5B6 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PAXBP1Q9Y5B6 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PAXBP1Q9Y5B6 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PAXBP1Q9Y5B6 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PAXBP1Q9Y5B6 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PAXBP1Q9Y5B6 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PAXBP1Q9Y5B6 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PAXBP1Q9Y5B6 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PAXBP1Q9Y5B6 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PAXBP1Q9Y5B6 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PAXBP1Q9Y5B6 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PAXBP1Q9Y5B6 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PAXBP1Q9Y5B6 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PAXBP1Q9Y5B6 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PAXBP1Q9Y5B6 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PAXBP1Q9Y5B6 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PAXBP1Q9Y5B6 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PAXBP1Q9Y5B6 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PAXBP1Q9Y5B6 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PAXBP1Q9Y5B6 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PAXBP1Q9Y5B6 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PAXBP1Q9Y5B6 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PAXBP1Q9Y5B6 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PAXBP1Q9Y5B6 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PAXBP1Q9Y5B6 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PAXBP1Q9Y5B6 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PAXBP1Q9Y5B6 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PAXBP1Q9Y5B6 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PAXBP1Q9Y5B6 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PAXBP1Q9Y5B6 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PAXBP1Q9Y5B6 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PAXBP1Q9Y5B6 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PAXBP1Q9Y5B6 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PAXBP1Q9Y5B6 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PAXBP1Q9Y5B6 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PAXBP1Q9Y5B6 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PAXBP1Q9Y5B6 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PAXBP1Q9Y5B6 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PAXBP1Q9Y5B6 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PAXBP1Q9Y5B6 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PAXBP1Q9Y5B6 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PAXBP1Q9Y5B6 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms