Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
PHF8Q9UPP1 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHF8Q9UPP1 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHF8Q9UPP1 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHF8Q9UPP1 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHF8Q9UPP1 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHF8Q9UPP1 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHF8Q9UPP1 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHF8Q9UPP1 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHF8Q9UPP1 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHF8Q9UPP1 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHF8Q9UPP1 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PHF8Q9UPP1 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHF8Q9UPP1 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHF8Q9UPP1 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHF8Q9UPP1 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHF8Q9UPP1 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHF8Q9UPP1 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHF8Q9UPP1 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHF8Q9UPP1 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHF8Q9UPP1 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHF8Q9UPP1 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHF8Q9UPP1 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHF8Q9UPP1 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHF8Q9UPP1 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHF8Q9UPP1 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHF8Q9UPP1 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHF8Q9UPP1 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHF8Q9UPP1 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHF8Q9UPP1 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHF8Q9UPP1 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHF8Q9UPP1 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHF8Q9UPP1 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHF8Q9UPP1 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHF8Q9UPP1 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PHF8Q9UPP1 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PHF8Q9UPP1 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHF8Q9UPP1 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHF8Q9UPP1 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHF8Q9UPP1 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHF8Q9UPP1 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHF8Q9UPP1 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHF8Q9UPP1 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHF8Q9UPP1 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PHF8Q9UPP1 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHF8Q9UPP1 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHF8Q9UPP1 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHF8Q9UPP1 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHF8Q9UPP1 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHF8Q9UPP1 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHF8Q9UPP1 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms