Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms