Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms