Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms