Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
REREQ9P2R6 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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