Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J2

IGSF9, Protein turtle homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9Q9P2J2 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms