Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RRBP1Q9P2E9 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRBP1Q9P2E9 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.3 ms