Protein–RNA interactions for Protein: Q9P244

LRFN1, Leucine-rich repeat and fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN1Q9P244 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRFN1Q9P244 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
LRFN1Q9P244 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRFN1Q9P244 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
LRFN1Q9P244 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRFN1Q9P244 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
LRFN1Q9P244 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRFN1Q9P244 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRFN1Q9P244 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRFN1Q9P244 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRFN1Q9P244 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRFN1Q9P244 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRFN1Q9P244 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRFN1Q9P244 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRFN1Q9P244 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRFN1Q9P244 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRFN1Q9P244 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRFN1Q9P244 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRFN1Q9P244 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRFN1Q9P244 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRFN1Q9P244 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRFN1Q9P244 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRFN1Q9P244 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRFN1Q9P244 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRFN1Q9P244 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRFN1Q9P244 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRFN1Q9P244 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
LRFN1Q9P244 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRFN1Q9P244 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRFN1Q9P244 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRFN1Q9P244 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRFN1Q9P244 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRFN1Q9P244 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRFN1Q9P244 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRFN1Q9P244 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRFN1Q9P244 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRFN1Q9P244 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
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LRFN1Q9P244 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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LRFN1Q9P244 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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LRFN1Q9P244 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LRFN1Q9P244 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LRFN1Q9P244 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LRFN1Q9P244 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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LRFN1Q9P244 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LRFN1Q9P244 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LRFN1Q9P244 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
LRFN1Q9P244 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LRFN1Q9P244 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LRFN1Q9P244 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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