Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC29.64■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 RPS18P9-201ENST00000482817 460 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 AC022080.1-201ENST00000366255 781 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms