Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWD8

TMEM248, Transmembrane protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248Q9NWD8 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM248Q9NWD8 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms