Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX15Q9NRS6 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms