Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
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