Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 DUOX2-201ENST00000389039 6533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
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