Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIFKQ9BYG3 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms