Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 AC084048.1-201ENST00000505494 640 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 KLRC1-204ENST00000536188 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC4A5Q9BY07 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms