Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTU6

PI4K2A, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4K2AQ9BTU6 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms