Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

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Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2AFJQ9BTM1 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2AFJQ9BTM1 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2AFJQ9BTM1 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2AFJQ9BTM1 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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H2AFJQ9BTM1 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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H2AFJQ9BTM1 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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H2AFJQ9BTM1 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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H2AFJQ9BTM1 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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H2AFJQ9BTM1 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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H2AFJQ9BTM1 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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H2AFJQ9BTM1 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2AFJQ9BTM1 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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