Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 AL354919.1-201ENST00000453837 2257 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 ELN-216ENST00000429192 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms