Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms