Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
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