Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NLRP3Q96P20 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NLRP3Q96P20 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NLRP3Q96P20 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NLRP3Q96P20 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NLRP3Q96P20 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NLRP3Q96P20 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NLRP3Q96P20 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NLRP3Q96P20 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NLRP3Q96P20 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NLRP3Q96P20 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NLRP3Q96P20 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NLRP3Q96P20 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NLRP3Q96P20 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NLRP3Q96P20 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NLRP3Q96P20 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NLRP3Q96P20 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NLRP3Q96P20 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NLRP3Q96P20 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NLRP3Q96P20 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NLRP3Q96P20 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NLRP3Q96P20 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NLRP3Q96P20 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NLRP3Q96P20 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NLRP3Q96P20 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NLRP3Q96P20 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NLRP3Q96P20 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NLRP3Q96P20 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NLRP3Q96P20 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NLRP3Q96P20 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NLRP3Q96P20 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NLRP3Q96P20 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NLRP3Q96P20 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NLRP3Q96P20 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NLRP3Q96P20 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NLRP3Q96P20 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NLRP3Q96P20 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NLRP3Q96P20 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NLRP3Q96P20 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NLRP3Q96P20 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NLRP3Q96P20 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NLRP3Q96P20 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NLRP3Q96P20 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NLRP3Q96P20 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NLRP3Q96P20 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NLRP3Q96P20 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NLRP3Q96P20 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NLRP3Q96P20 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NLRP3Q96P20 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NLRP3Q96P20 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NLRP3Q96P20 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NLRP3Q96P20 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NLRP3Q96P20 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NLRP3Q96P20 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NLRP3Q96P20 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NLRP3Q96P20 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NLRP3Q96P20 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NLRP3Q96P20 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NLRP3Q96P20 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NLRP3Q96P20 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NLRP3Q96P20 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NLRP3Q96P20 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NLRP3Q96P20 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NLRP3Q96P20 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NLRP3Q96P20 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NLRP3Q96P20 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NLRP3Q96P20 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NLRP3Q96P20 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NLRP3Q96P20 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NLRP3Q96P20 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NLRP3Q96P20 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NLRP3Q96P20 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NLRP3Q96P20 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NLRP3Q96P20 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NLRP3Q96P20 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NLRP3Q96P20 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NLRP3Q96P20 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NLRP3Q96P20 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NLRP3Q96P20 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NLRP3Q96P20 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NLRP3Q96P20 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NLRP3Q96P20 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NLRP3Q96P20 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NLRP3Q96P20 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLRP3Q96P20 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLRP3Q96P20 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLRP3Q96P20 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLRP3Q96P20 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLRP3Q96P20 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLRP3Q96P20 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLRP3Q96P20 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLRP3Q96P20 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLRP3Q96P20 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLRP3Q96P20 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLRP3Q96P20 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLRP3Q96P20 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLRP3Q96P20 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLRP3Q96P20 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLRP3Q96P20 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLRP3Q96P20 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms