Protein–RNA interactions for Protein: Q96P16

RPRD1A, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1AQ96P16 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPRD1AQ96P16 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RPRD1AQ96P16 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPRD1AQ96P16 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPRD1AQ96P16 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPRD1AQ96P16 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPRD1AQ96P16 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPRD1AQ96P16 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPRD1AQ96P16 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPRD1AQ96P16 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPRD1AQ96P16 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPRD1AQ96P16 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPRD1AQ96P16 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPRD1AQ96P16 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPRD1AQ96P16 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPRD1AQ96P16 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPRD1AQ96P16 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPRD1AQ96P16 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPRD1AQ96P16 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPRD1AQ96P16 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPRD1AQ96P16 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPRD1AQ96P16 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPRD1AQ96P16 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPRD1AQ96P16 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPRD1AQ96P16 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPRD1AQ96P16 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPRD1AQ96P16 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPRD1AQ96P16 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPRD1AQ96P16 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPRD1AQ96P16 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPRD1AQ96P16 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPRD1AQ96P16 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPRD1AQ96P16 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPRD1AQ96P16 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPRD1AQ96P16 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPRD1AQ96P16 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPRD1AQ96P16 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPRD1AQ96P16 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPRD1AQ96P16 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPRD1AQ96P16 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPRD1AQ96P16 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPRD1AQ96P16 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPRD1AQ96P16 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPRD1AQ96P16 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPRD1AQ96P16 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPRD1AQ96P16 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPRD1AQ96P16 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPRD1AQ96P16 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPRD1AQ96P16 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPRD1AQ96P16 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPRD1AQ96P16 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPRD1AQ96P16 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPRD1AQ96P16 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPRD1AQ96P16 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPRD1AQ96P16 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPRD1AQ96P16 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPRD1AQ96P16 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPRD1AQ96P16 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPRD1AQ96P16 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPRD1AQ96P16 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPRD1AQ96P16 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms