Protein–RNA interactions for Protein: Q96D59

RNF183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF183Q96D59 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms