Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms