Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 FAM32A-204ENST00000588367 798 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRG4Q92954 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms