Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM41Q8WV44 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM41Q8WV44 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM41Q8WV44 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM41Q8WV44 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM41Q8WV44 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM41Q8WV44 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM41Q8WV44 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM41Q8WV44 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM41Q8WV44 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM41Q8WV44 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM41Q8WV44 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM41Q8WV44 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM41Q8WV44 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM41Q8WV44 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM41Q8WV44 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM41Q8WV44 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM41Q8WV44 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM41Q8WV44 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM41Q8WV44 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM41Q8WV44 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM41Q8WV44 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM41Q8WV44 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM41Q8WV44 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM41Q8WV44 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM41Q8WV44 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM41Q8WV44 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM41Q8WV44 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM41Q8WV44 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM41Q8WV44 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM41Q8WV44 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM41Q8WV44 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM41Q8WV44 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM41Q8WV44 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM41Q8WV44 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM41Q8WV44 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM41Q8WV44 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM41Q8WV44 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM41Q8WV44 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM41Q8WV44 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM41Q8WV44 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM41Q8WV44 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM41Q8WV44 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM41Q8WV44 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM41Q8WV44 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM41Q8WV44 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM41Q8WV44 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM41Q8WV44 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM41Q8WV44 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM41Q8WV44 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM41Q8WV44 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM41Q8WV44 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM41Q8WV44 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM41Q8WV44 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM41Q8WV44 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM41Q8WV44 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM41Q8WV44 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM41Q8WV44 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM41Q8WV44 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM41Q8WV44 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM41Q8WV44 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM41Q8WV44 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM41Q8WV44 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM41Q8WV44 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM41Q8WV44 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM41Q8WV44 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM41Q8WV44 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM41Q8WV44 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM41Q8WV44 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM41Q8WV44 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM41Q8WV44 AP003900.1-201ENST00000622592 859 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM41Q8WV44 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM41Q8WV44 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM41Q8WV44 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM41Q8WV44 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM41Q8WV44 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM41Q8WV44 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM41Q8WV44 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM41Q8WV44 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM41Q8WV44 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM41Q8WV44 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM41Q8WV44 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM41Q8WV44 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM41Q8WV44 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM41Q8WV44 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM41Q8WV44 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM41Q8WV44 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM41Q8WV44 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM41Q8WV44 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM41Q8WV44 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM41Q8WV44 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM41Q8WV44 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms