Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBC4

UBA3, NEDD8-activating enzyme E1 catalytic subunit, humanhuman

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA3Q8TBC4 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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