Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ANKRD42Q8N9B4 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ANKRD42Q8N9B4 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ANKRD42Q8N9B4 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ANKRD42Q8N9B4 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ANKRD42Q8N9B4 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ANKRD42Q8N9B4 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ANKRD42Q8N9B4 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ANKRD42Q8N9B4 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ANKRD42Q8N9B4 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ANKRD42Q8N9B4 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ANKRD42Q8N9B4 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ANKRD42Q8N9B4 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ANKRD42Q8N9B4 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ANKRD42Q8N9B4 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ANKRD42Q8N9B4 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ANKRD42Q8N9B4 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ANKRD42Q8N9B4 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ANKRD42Q8N9B4 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ANKRD42Q8N9B4 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ANKRD42Q8N9B4 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ANKRD42Q8N9B4 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ANKRD42Q8N9B4 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ANKRD42Q8N9B4 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ANKRD42Q8N9B4 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ANKRD42Q8N9B4 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ANKRD42Q8N9B4 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ANKRD42Q8N9B4 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ANKRD42Q8N9B4 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ANKRD42Q8N9B4 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ANKRD42Q8N9B4 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ANKRD42Q8N9B4 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ANKRD42Q8N9B4 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ANKRD42Q8N9B4 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ANKRD42Q8N9B4 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ANKRD42Q8N9B4 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ANKRD42Q8N9B4 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ANKRD42Q8N9B4 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ANKRD42Q8N9B4 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD42Q8N9B4 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD42Q8N9B4 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD42Q8N9B4 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD42Q8N9B4 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD42Q8N9B4 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD42Q8N9B4 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD42Q8N9B4 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD42Q8N9B4 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD42Q8N9B4 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD42Q8N9B4 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD42Q8N9B4 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD42Q8N9B4 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD42Q8N9B4 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD42Q8N9B4 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD42Q8N9B4 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD42Q8N9B4 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD42Q8N9B4 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD42Q8N9B4 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD42Q8N9B4 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD42Q8N9B4 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD42Q8N9B4 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD42Q8N9B4 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD42Q8N9B4 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD42Q8N9B4 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD42Q8N9B4 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD42Q8N9B4 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD42Q8N9B4 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD42Q8N9B4 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD42Q8N9B4 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD42Q8N9B4 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD42Q8N9B4 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD42Q8N9B4 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD42Q8N9B4 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD42Q8N9B4 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD42Q8N9B4 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD42Q8N9B4 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD42Q8N9B4 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD42Q8N9B4 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD42Q8N9B4 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD42Q8N9B4 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD42Q8N9B4 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD42Q8N9B4 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ANKRD42Q8N9B4 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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