Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms