Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC50Q8IVM0 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms