Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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ATG4DQ86TL0 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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ATG4DQ86TL0 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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ATG4DQ86TL0 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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ATG4DQ86TL0 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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ATG4DQ86TL0 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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ATG4DQ86TL0 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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ATG4DQ86TL0 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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ATG4DQ86TL0 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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ATG4DQ86TL0 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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ATG4DQ86TL0 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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ATG4DQ86TL0 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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ATG4DQ86TL0 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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ATG4DQ86TL0 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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ATG4DQ86TL0 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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ATG4DQ86TL0 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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