Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SYT9Q86SS6 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
SYT9Q86SS6 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
SYT9Q86SS6 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SYT9Q86SS6 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SYT9Q86SS6 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SYT9Q86SS6 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SYT9Q86SS6 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SYT9Q86SS6 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SYT9Q86SS6 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SYT9Q86SS6 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SYT9Q86SS6 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SYT9Q86SS6 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SYT9Q86SS6 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SYT9Q86SS6 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SYT9Q86SS6 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SYT9Q86SS6 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SYT9Q86SS6 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SYT9Q86SS6 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SYT9Q86SS6 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SYT9Q86SS6 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SYT9Q86SS6 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SYT9Q86SS6 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SYT9Q86SS6 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SYT9Q86SS6 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SYT9Q86SS6 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SYT9Q86SS6 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SYT9Q86SS6 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SYT9Q86SS6 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SYT9Q86SS6 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SYT9Q86SS6 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SYT9Q86SS6 AC124312.2-201ENST00000546615 427 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SYT9Q86SS6 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SYT9Q86SS6 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SYT9Q86SS6 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SYT9Q86SS6 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SYT9Q86SS6 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SYT9Q86SS6 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SYT9Q86SS6 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SYT9Q86SS6 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SYT9Q86SS6 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SYT9Q86SS6 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SYT9Q86SS6 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SYT9Q86SS6 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SYT9Q86SS6 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SYT9Q86SS6 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SYT9Q86SS6 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SYT9Q86SS6 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SYT9Q86SS6 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SYT9Q86SS6 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SYT9Q86SS6 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SYT9Q86SS6 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SYT9Q86SS6 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SYT9Q86SS6 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SYT9Q86SS6 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SYT9Q86SS6 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SYT9Q86SS6 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SYT9Q86SS6 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SYT9Q86SS6 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SYT9Q86SS6 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SYT9Q86SS6 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SYT9Q86SS6 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms