Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR0

NLRP9, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP9Q7RTR0 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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