Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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USP43Q70EL4 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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USP43Q70EL4 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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USP43Q70EL4 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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USP43Q70EL4 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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USP43Q70EL4 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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USP43Q70EL4 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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USP43Q70EL4 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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USP43Q70EL4 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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USP43Q70EL4 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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USP43Q70EL4 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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USP43Q70EL4 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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USP43Q70EL4 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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