Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms