Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXI7

VIT, Vitrin, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VITQ6UXI7 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VITQ6UXI7 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms