Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXD1

HRCT1, Histidine-rich carboxyl terminus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCT1Q6UXD1 GAS8-220ENST00000620723 3308 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 GLI3-201ENST00000395925 8208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 RBM33-203ENST00000341148 7058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 MYO9B-206ENST00000595618 7623 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 AC010547.1-201ENST00000500612 2793 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 AC010536.1-201ENST00000538868 2611 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 OR2I1P-208ENST00000641137 4948 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 MUC20-205ENST00000447234 2589 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 ZNF148-206ENST00000485866 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 CCDC144NL-201ENST00000327925 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 MYO7A-205ENST00000458637 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 SPTBN2-210ENST00000611817 2890 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 WDR47-204ENST00000369965 4240 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 CCDC148-201ENST00000283233 3122 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 DCDC2-202ENST00000378454 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 CAMSAP1-202ENST00000389532 7696 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 AC106788.1-201ENST00000550753 2661 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 TRAK1-210ENST00000613405 4672 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 SNHG20-202ENST00000434411 2143 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 NUP54-201ENST00000264883 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 ATP13A2-201ENST00000326735 3840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 AMER3-202ENST00000423981 6172 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms