Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ2

TNS3, Tensin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TNS3Q68CZ2 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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TNS3Q68CZ2 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TNS3Q68CZ2 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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TNS3Q68CZ2 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TNS3Q68CZ2 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TNS3Q68CZ2 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TNS3Q68CZ2 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TNS3Q68CZ2 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
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