Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 FDPSP7-201ENST00000429043 1054 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 AC079325.1-201ENST00000430386 857 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 AC103563.2-201ENST00000442200 597 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 AL110503.1-201ENST00000457224 534 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 AC011483.3-201ENST00000601506 826 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 ZFAS1-208ENST00000618800 597 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 NAP1L1-226ENST00000552342 1526 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 PSMC5-201ENST00000310144 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 AC016590.1-201ENST00000588763 420 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 RPAIN-202ENST00000381208 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 C6orf203-201ENST00000311381 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 AC004801.1-201ENST00000549557 360 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 AC091304.3-201ENST00000566500 716 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 PRMT1P1-201ENST00000604252 1009 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 SUMO1-202ENST00000392245 1071 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 LYRM1-202ENST00000396052 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM208BQ5VWN6 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms