Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT06

CEP350, Centrosome-associated protein 350, humanhuman

Predictions only

Length 3,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP350Q5VT06 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 CLUAP1-201ENST00000341633 1643 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 DAP3-201ENST00000343043 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 AC138627.1-201ENST00000641127 1257 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 NKAPP1-204ENST00000555168 557 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 IP6K2-211ENST00000432678 1309 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 DDIAS-204ENST00000525388 961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 OAZ3-201ENST00000321531 851 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 CCDC153-202ENST00000415318 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 DPH2-202ENST00000396758 1738 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 AC048380.1-201ENST00000589818 465 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 AL590556.2-202ENST00000636906 844 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 HNF4A-206ENST00000457232 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 CD8B-202ENST00000349455 849 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 PPP1R2P10-201ENST00000393023 595 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 GABARAPL1-213ENST00000544284 531 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 ARL17B-207ENST00000575960 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP350Q5VT06 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms