Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNT1Q5JUK3 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNT1Q5JUK3 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNT1Q5JUK3 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNT1Q5JUK3 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNT1Q5JUK3 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNT1Q5JUK3 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNT1Q5JUK3 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNT1Q5JUK3 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNT1Q5JUK3 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNT1Q5JUK3 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNT1Q5JUK3 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNT1Q5JUK3 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNT1Q5JUK3 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNT1Q5JUK3 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNT1Q5JUK3 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNT1Q5JUK3 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNT1Q5JUK3 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNT1Q5JUK3 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNT1Q5JUK3 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNT1Q5JUK3 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNT1Q5JUK3 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNT1Q5JUK3 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNT1Q5JUK3 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNT1Q5JUK3 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNT1Q5JUK3 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNT1Q5JUK3 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNT1Q5JUK3 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNT1Q5JUK3 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNT1Q5JUK3 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNT1Q5JUK3 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNT1Q5JUK3 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNT1Q5JUK3 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNT1Q5JUK3 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNT1Q5JUK3 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNT1Q5JUK3 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNT1Q5JUK3 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNT1Q5JUK3 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNT1Q5JUK3 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNT1Q5JUK3 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNT1Q5JUK3 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNT1Q5JUK3 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNT1Q5JUK3 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNT1Q5JUK3 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNT1Q5JUK3 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNT1Q5JUK3 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNT1Q5JUK3 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNT1Q5JUK3 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNT1Q5JUK3 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNT1Q5JUK3 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNT1Q5JUK3 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNT1Q5JUK3 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNT1Q5JUK3 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNT1Q5JUK3 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNT1Q5JUK3 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNT1Q5JUK3 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNT1Q5JUK3 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.3 ms